Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms