Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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