Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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