Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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