Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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