Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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