Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RPE65Q16518 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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