Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms