Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms