Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms