Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEA1Q15075 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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