Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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RAB3GAP1Q15042 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RAB3GAP1Q15042 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RAB3GAP1Q15042 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RAB3GAP1Q15042 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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RAB3GAP1Q15042 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3GAP1Q15042 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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