Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CHD4Q14839 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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