Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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