Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms