Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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CKAP5Q14008 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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