Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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