Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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