Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms