Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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