Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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