Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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