Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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