Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
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