Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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