Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HSPB3Q12988 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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