Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXF2Q12947 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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