Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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