Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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