Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms