Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms