Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms