Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms