Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPAQ06546 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms