Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms