Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms