Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms