Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ARHGDIB-201ENST00000228945 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 RN7SL819P-201ENST00000581896 270 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC012065.5-201ENST00000624084 510 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AP000941.1-201ENST00000530198 1388 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 MDH1-216ENST00000544381 1346 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC005692.1-201ENST00000461145 1439 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SAMMSON-206ENST00000641053 1516 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PRL-203ENST00000617911 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL445675.1-201ENST00000603868 1410 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms