Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms