Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN2Q02246 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN2Q02246 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN2Q02246 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN2Q02246 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN2Q02246 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN2Q02246 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms