Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms