Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms