Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED6P86452 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms