Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms