Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms