Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF10P55107 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDF10P55107 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDF10P55107 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDF10P55107 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDF10P55107 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDF10P55107 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF10P55107 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms