Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGA8P53708 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms