Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF6P49848 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF6P49848 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms