Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQGAP1P46940 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQGAP1P46940 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms