Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms